【RNase R-核糖核酸酶R】E. coli exoribonuclease-circRNAs貨號E049

RNase R 核糖核酸酶R | DNA & RNA Modifying Enzymes 貨號E049 500 U (50 μl) 10U/ul

NGS-Enzymes

RNase R

核糖核酸酶R (RNase R )是一種大腸桿菌核糖核酸外切酶 ( E. coli exoribonuclease)，具有3’至5’核酸外切酶活性，能夠有效地消化幾乎所有的線性RNA ( linear RNA) 種類和Y結構RNA。該酶不能消化具有短3’突出端（小於7個核苷酸）的環狀 ( circular) ，套索狀(lariat)或雙鏈(double stranded) RNA，保留套索RNA的環部分。因此，這種酶非常適合於研究由傳統剪接產生的套索RNA( circRNAs)，以及通過反向剪接產生的circRNA。 RNase R通過從細胞或RNA提取物中去除線性RNA，RNase R經由RNA-sequencing有效鑑定環狀物種。

Enriching circRNAs in biological samples
• Identification of intronic lariat sequences
• Identification of exonic circRNAs
• Studying alternative splicing
• Production of artificial circular RNAs

黴漿菌PCR偵測 | DAPI染核 | 細胞內黴漿菌去除劑 | 水浴槽抑菌劑 | 噴霧式去黴劑等系列商品

Concentration	10 U/μl
Storage	Store all components at -20 °C. Avoid repeated freeze-thaw cycles of all components to retain maximum performance. All components are stable for 1 year from the date of shipping when stored and handled properly.
Storage Buffer	50 mM Tris-HCl (pH 7.5), 100mM NaCl, 0.1 mM EDTA, 1 mM DTT, and 50% (v/v) Glycerol.
Reaction Buffer	200 mM Tris-HCl, 1 M KCl, 1 mM MgCl2, pH 7.5

RNase R酵素使用注意事項

如果降解效率低，則使用稍高的孵育溫度（40-45°C）在中途補充額外的酶（0.5μl 1小時）。較高的溫度對於降解高度結構化的線性RNA（例如rRNA）特別有用。超過45°C或孵育超過3小時，亦可能導致非酶促RNA降解。最佳活性需要濃度為0.1-1.0mM的鎂 ( Magnesium )。如果存在EDTA，則通過添加MgCl 2至最終1.0mM進行補償。RNase R對tRNA，rRNA和其他高度結構化的RNA表現出低活性，其3’末端是雙鏈的，具有短的3’突出端。這些RNA種類可使酶停滯並導致活性大大降低。為獲得最佳結果，強烈建議從總RNA提取物中去除rRNA。對於總RNA的消化，通常需要2-3小時的更長時間的incubations。One unit定義為在37℃下在10分鐘內將1μg poly(A) 轉化為酸溶性核苷酸 ( acid-soluble nucleotides)的RNase R的量。