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【APExBIO/Aapexbt 】Chromatin/Epigenetics表觀遺傳學-APExBIO台灣代理商

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APExBIO台灣代理商

APExBIO提供優質的胜肽和生物分析試劑,廣泛產品線如Protease、Chromatin/Epigenetics表觀遺傳學、MAPK Signal、DNA Damege/DNA repair、細胞凋亡、腫瘤生物學、Stem cell等研究領域, 還提供定制的服務,包括多肽合成,抗體的生產和檢測的發展。產品線DNA/RNA prep kit、Drug Screening panel、Bioactive peptides、Growth factors、Biotinylation Reagents、tag peptides、amino Acids、Growth factors等。APExBIO產品質量都伴隨著證書的分析,高效液相色譜,質譜,和HMNR數據。APExBIO提供一系列Chromatin/Epigenetics表觀遺傳學之生物化合物, 包括MG 149  (Tip60 HAT inhibitor) 選擇性抑制劑 、4′-bromo-Resveratrol、MS023、CHZ868、Chidamide、RGFP966、EPZ-6438、Bromodomain Inhibitor, (+)-JQ1等系列商品。

 

表觀遺傳學(Epigenetics)是基因表達的可遺傳修飾(heritable modifications),與 DNA 序列(DNA sequence)的變化無關。表觀遺傳修飾(Epigenetic modifications)主要發生在 DNA 或組蛋白八聚體(histone octamer)上。有幾種類型的表觀遺傳學修飾(epigenetics modifications),DNA-甲基轉移酶 (DNMT) 的 DNA 甲基化和組蛋白的共價修飾,例如乙醯化(acetylation)、甲基化(methylation)、磷酸化(phosphorylation)和泛素化(ubiquitination)。組蛋白乙醯轉移酶 (HAT) 的組蛋白乙醯化參與轉錄激活,而組蛋白去乙醯化酶 (HDAC) 的組蛋白去乙醯化與轉錄抑制(transcriptional repression)有關。組蛋白去甲基化(Histone demethylation)與賴氨酸特異性去甲基化酶 (lysine-specific demethylase , LSD) 和含有組蛋白去甲基化酶 (JHDM) 的 JmjC 結構域(JmjC domain)有關。

核小體(nucleosome)由四種組蛋白(H2A、H2B、H3 和 H4)組成,它們是染色質(chromatin)的主要組成部分。特定化學基團的添加和去除稱為表觀遺傳標記(epigenetic marks),它調節染色質結構並影響基因表達。此外,RNA 與抑制性染色質狀態(repressive chromatin state)的形成密切相關。

表觀遺傳(Epigenetic)機制在細胞水平上響應環境變化,從而影響細胞可塑性(plasticity)。染色質(Chromatin)和表觀遺傳調控(epigenetic regulation)在發育和應激反應期間的基因組編程中發揮重要作用,表觀遺傳學缺陷(defects in epigenetics)可導致癌症(cancer)、炎症(inflammation)和代謝紊亂(metabolic disorders)等。MG 149 是一種組蛋白乙酰轉移酶 (HAT) 抑製劑,對 Tip60 和 MOF 的 IC50 值分別為 74μM 和 47μM [1]。

MG 149  (Tip60 HAT inhibitor) 選擇性抑制劑 | CAS# 1243583-85-8 APExBIO貨號 B3276

MG 149 是漆樹酸衍生物(anacardic acid derivative)。它顯示對 MYST 類型的 HAT(histone acetyltransferases):Tip60 和 MOF 的選擇性抑制(selective inhibition),IC50 值分別為 74μM 和 47μM。對接研究表明,MG 149 對 Tip60 的抑制作用相對於 Tip60 的 Ac-CoA 結合口袋中的 Ac-CoA 具有競爭性。 MG 149 還使用生物素化組蛋白 H3 或組蛋白 H4 肽作為底物抑制 HeLa 細胞核提取物中 HAT 的活性。與組蛋白 H4 相比,它被發現對組蛋白 H3 更有效。此外,DNA 微陣列(DNA microarrays) , 顯示 MG149 抑制 p53 和 NF-kB 通路以及數量非常有限的其他通路 [1, 2]。

  • 1. Zichong Li. “Functional characterization of transcription elongation machinery in HIV transcription and latency.” University of California. 2019.
  • 2. Li Z, Mbonye U, et al. “The KAT5-Acetyl-Histone4-Brd4 axis silences HIV-1 transcription and promotes viral latency.” PLoS Pathog. 2018 Apr 23;14(4):e1007012. PMID:29684085

4′-bromo-Resveratrol (Sirt1 和 Sirt3 抑制劑) | CAS# 1224713-90-9 APExBIO貨號 C3552

4′-bromo-Resveratrol 是一種 Sirt1 和 Sirt3 抑制劑。Sirtuins 是調節衰老過程(aging processes)和許多生理功能的蛋白質脫乙醯酶(protein deacetylases)。白藜蘆醇可激活人類 Sirt1 並抑制 Sirt3,並可以模擬卡路里限制效應(mimic calorie restriction),包括在低等生物中延長壽命。體外(In vitro):在先前的研究中使用 4′-溴白藜蘆醇(4’-bromo-Resveratrol)研究了去乙酰化酶調節。  4′-溴白藜蘆醇(4’-bromo-Resveratrol)抑制 Sirt3 的效力比白藜蘆醇高得多,而且它還抑制而不是激活 Sirt1。人 Sirt3/4′-溴白藜蘆醇肽複合物的晶體結構確定了兩個結合位點。內部位點引起了有效的抑制作用。  4′-溴白藜蘆醇(4’-bromo-Resveratrol)干擾 NAD+ 和底物肽的結合,並將其溴-苯基基團延伸到無法識別的位點口袋中。發現  4′-溴白藜蘆醇(4’-bromo-Resveratrol)的第二個結合位點位於 Sirt3 的表面,並通過兩個螺旋連接到肽結合活性位點環。在 Sirt1 中,該位點似乎包含一個對其被小分子激活至關重要的殘基,因此4′-溴白藜蘆醇(4’-bromo-Resveratrol)構成了長期尋找的變構 Sirt1 激活劑結合位點的候選者(candidate) [1]。體內(In vivo):到目前為止,還沒有 4′-溴白藜蘆醇(4’-bromo-Resveratrol)的動物體內數據。臨床試驗:截至目前,4′-溴白藜蘆醇(4’-bromo-Resveratrol)仍處於臨床前開發階段(preclinical development stage)。

c3552 CAS-1224713-90-9

  • 1. Wang LJ, Lee YC, et al. “Non-mitotic effect of albendazole triggers apoptosis of human leukemia cells via SIRT3/ROS/p38 MAPK/TTP axis-mediated TNF-α upregulation.” Biochem Pharmacol. 2018 Nov 7. pii: S0006-2952(18)30472-6. PMID:30414389

 

MS023 (type I PRMTs inhibitor抑制劑) | CAS# 1831110-54-3APExBIO貨號 B6183

 

MS023 is a type I PRMTs inhibitor.Protein arginine methyltransferases (PRMTs) play a critical role in various biological processes. PRMT overexpression has been observed in a variety of human diseases including cancer. PRMTs has been divided into three categories: type I PRMTs for catalyzing mono- and asymmetric dimethylation of arginine residues, type II PRMTs for catalyzing mono- and symmetric dimethylation of arginine residues, and type III PRMT for catalyzing only monomethylation of arginine residues.

MS023 (type I PRMTs inhibitor抑制劑) CAS# 1831110-54-3APExBIO貨號 B6183

MS023 是一種 I 型 PRMTs 抑制劑。蛋白質精氨酸甲基轉移酶 (inhibitor.Protein arginine methyltransferases ,PRMT) 在各種生物過程中發揮著關鍵作用。已在包括癌症(cancer)在內的多種人類疾病中觀察到 PRMT 過度表達(overexpression)。 PRMTs分為三類:I型PRMTs用於催化精氨酸殘基(arginine residues)的單甲基化和不對稱二甲基化,II型PRMTs用於催化精氨酸殘基(arginine residues)的單甲基化和對稱二甲基化(symmetric demethylation),III型PRMTs僅催化精氨酸殘基的單甲基化(monomethylation)。體外(In vitro):先前的研究表明,MS023 對 I 型 PRMT 具有出色的效力,但對 II 型和 III 型 PRMT、蛋白質賴氨酸甲基轉移酶(protein lysine methyltransferases)以及 DNA 甲基轉移酶(DNA methyltransferases)均完全無活性。此外,PRMT6 與 MS023 的晶體結構表明 MS023 與底物結合位點結合。此外,MS023 可以有效降低組蛋白精氨酸不對稱二甲基化的細胞水平。此外,MS023 可以降低精氨酸不對稱二甲基化的水平,同時還可以增加精氨酸單甲基化和對稱二甲基化的細胞水平 [1]。體內:到目前為止,還沒有動物體內數據報導。臨床試驗:截至目前,MS023仍處於臨床前開發階段。

  • 1. Pyun JH, Kim HJ, et al. “Cardiac specific PRMT1 ablation causes heart failure through CaMKII dysregulation.” Nat Commun. 2018 Nov 30;9(1):5107. PMID:30504773

 

CHZ868 | APExBIO  貨號B5980 Type II JAK2 inhibitor

 

CHZ868 是一種 II 型 JAK2 抑制劑,IC50 值為 110 nM [1]。JAK2(Janus 激酶 2)是一種非受體酪氨酸激酶(non-receptor tyrosine kinase)。 JAK2 的突變與許多骨髓增生性(myeloproliferative disorders)疾病有關。在 CRLF2 重排的人 B-ALL 細胞 MHH-CALL4 中,CHZ868 有效抑制 JAK2 磷酸化和細胞生長 [1]。 CHZ868 是一種 II 型 JAK2 抑制劑。在 JAK2V617F SET2 細胞中,CHZ868 有效抑制組成型 JAK2 和 STAT5 磷酸化,並抑制細胞增殖,GI50 值為 59 nM。在 MPLW515L 突變細胞中,CHZ868 有效抑制細胞增殖並消除 JAK2 激活環中 Y1007/Y1008 的磷酸化。在 I 型 JAK 抑制劑持久性細胞中,CHZ868 有效且濃度依賴性地抑制 JAK2 磷酸化和 JAK2V617F 或 MPLW515L 細胞的增殖(cell proliferation) [2]。在患有人類或鼠 B-ALL 的小鼠中,CHZ868 提高了存活率。在 JAK2 依賴性 B-ALL 小鼠中,與單獨使用 CHZ868 相比,CHZ868 和地塞米松(dexamethasone)協同誘導細胞凋亡並提高存活率 [1]。在 Jak2V617F 驅動的紅細胞增多症 (polycythemiavera , PV) 中,CHZ868(30 – 40 mg/kg 口服,每天一次)抑制 JAK-STAT 信號傳導並顯著降低骨髓中突變細胞的比例。在 MPLW515L 誘導的骨髓纖維化 (MF) 中,CHZ868 完全抑制 STAT3 和 STAT5 磷酸化,並降低 JAK2 磷酸化。 CHZ868 還以劑量依賴的方式提高了生存率並減少了肝腫大(hepatomegaly) [2]。

  1. Tvorogov D, Thomas D, et al. “Accumulation of JAK activation loop phosphorylation is linked to type I JAK inhibitor withdrawal syndrome in myelofibrosis.” Sci Adv. 2018 Nov 28;4(11):eaat3834.PMID:30498775

Chidamide | CAS#743420-02-2APExBIO  貨號B5916

Product Citation+1

Novel HDAC inhibitor

Chidamide 是一種新型苯甲酰胺型組蛋白脫乙醯酶 (benzamide-type histone deacetylase , HDAC) 抑制劑。人們研究了 CS055 對人白血病細胞系和原發性骨髓性白血病細胞增殖(proliferation)、分化(differentiation)和凋亡(apoptosis)的影響。組蛋白去乙醯化酶 (Histone deacetylases , HDAC) 是一系列酶,其作用是使組蛋白的氨基末端賴氨酸殘基(amino-terminal lysine residues)乙醯化和去乙醯化,從而導致染色質結構的重塑(remodeling)並影響染色質(chromatin)對轉錄因子的可及性,從而啟動基因轉錄(gene transcription)。 [2 ]西達本胺(Chidamide) 對細胞週期(cell cycle)有影響,它顯著降低了不同 p53 狀態的 BEL-7402 和 HCC-9204 細胞的 S 期細胞分數,同時誘導 G1 期細胞分數顯著增加。隨著劑量的增加,西達本胺(Chidamide)顯著改變了階段分數中的細胞數量。 [2]本研究結果表明,西達本胺(Chidamide)是一種 HDACi,通過抑制細胞增殖(cell proliferation)、誘導人體細胞分化(differentiation)和凋亡(apoptosis),在多種血液系統惡性腫瘤(haematological malignancies)中具有潛在的治療價值。

RGFP966 | CAS#1357389-11-7/1396841-57-8 APExBIO  貨號A8803

Product Citation+4

Specific HDAC3 inhibitor

Chidamide 是一種新型苯甲醯胺型組蛋白脫乙醯酶 (benzamide-type histone deacetylase , HDAC) 抑制劑。人們研究了 CS055 對人白血病細胞系和原發性骨髓性白血病細胞增殖(proliferation)、分化(differentiation)和凋亡(apoptosis)的影響。組蛋白去乙醯化酶 (Histone deacetylases , HDAC) 是一系列酶,其作用是使組蛋白的氨基末端賴氨酸殘基(amino-terminal lysine residues)乙醯化和去乙醯化,從而導致染色質結構的重塑(remodeling)並影響染色質(chromatin)對轉錄因子的可及性,從而啟動基因轉錄(gene transcription)。 [2 ]西達本胺(Chidamide) 對細胞週期(cell cycle)有影響,它顯著降低了不同 p53 狀態的 BEL-7402 和 HCC-9204 細胞的 S 期細胞分數,同時誘導 G1 期細胞分數顯著增加。隨著劑量的增加,西達本胺(Chidamide)顯著改變了階段分數中的細胞數量。 [2]本研究結果表明,西達本胺(Chidamide)是一種 HDACi,通過抑制細胞增殖(cell proliferation)、誘導人體細胞分化(differentiation)和凋亡(apoptosis),在多種血液系統惡性腫瘤(haematological malignancies)中具有潛在的治療價值。

1. Zhang M, Urabe G, et al. “HDAC6 Regulates the MRTF-A/SRF Axis and Vascular Smooth Muscle Cell Plasticity.” JACC Basic Transl Sci. 2018 Dec 31;3(6):782-795. PMID:30623138

2. Huang L, Lai WH, et al. “Elimination of HIV-1 Latently Infected Cells by Gnidimacrin and a Selective HDAC Inhibitor.” ACS Med Chem Lett. 2018 Feb 6;9(3):268-273. PMID:2954137

3. Topper MJ, Vaz M, et al. “Epigenetic Therapy Ties MYC Depletion to Reversing Immune Evasion and Treating Lung Cancer.” Cell. 2017 Nov 30;171(6):1284-1300.e21. PMID:29195073

4. Sun XY, Qu Y, et al. “Novel histone deacetylase inhibitor N25 exerts anti-tumor effects and induces autophagy in human glioma cells by inhibiting HDAC3.”Oncotarget. 2017 Sep 8;8(43):75232-75242. PMID:29088860

 

EPZ-6438 | CAS#1403254-99-8 APExBIO  貨號A8221

EZH2 inhibitor, potent and selective

EPZ-6438 是一種有效且具有生物活性的 EZH2 抑制劑,EZH2 是多梳抑制複合物 2 (polycomb repressive complex 2 , PRC2) 的催化亞基,可催化組蛋白 H3 (H3K27) 的賴氨酸 27 的甲基化,從而抑制含有人 PRC2 的野生型的活性EZH2 的抑制常數 Ki 值為 2.5 nM。 EPZ-6438 競爭性結合 EZH2 的 S-腺苷甲硫氨酸 (S-adenosylmethionine , SAM) 結合位點,也非競爭性結合肽或核小體底物的結合位點。 EPZ-6438 選擇性抑制 EZH2,選擇性比 EZH1 高 35 倍。研究結果表明,通過 EPZ-6438 介導的 EZH2 抑制對幾種癌症途徑的協同作用,EPZ-6438 在 MRT 模型中表現出顯著且持久的抗腫瘤活性。

Bromodomain Inhibitor, (+)-JQ1 | CAS# 1268524-70-4  APExBIO  貨號A1910

BET bromodomain inhibitor

Bromodomain Inhibitor, (+)-JQ1 是一種有效且高度特異性的 BET(bromodomain and extra-terminal, 溴結構域和末端外)家族的溴結構域抑制劑。 (+)-JQ1 與 BRD4 溴結構域 1 和 2 結合,Kd 值分別為 ~ 50 和 90 nM。該結合與乙醯賴氨酸(acetyl lysine)競爭。 (+)-JQ1 可以作為一種有用的化學探針來研究 BET 溴結構域在腫瘤發生的轉錄調控中的作用。JQ1 對 BRDT 表現出強烈的劑量和時間依賴性抑制作用,並且可以顯著降低 BRDT 結構近親的活性。仔細觀察 JQ1 結合的 BRDT 證實 BRDT 的乙醯賴氨酸識別位點被阻斷。 [1]JQ1 不產生鎮靜或抗焦慮作用,而是一種有效且選擇性的溴結構域睾丸特異性蛋白 BRDT [2] 抑制劑,該蛋白對精子發生過程中的染色質重塑至關重要。通過阻斷 BRDT,JQ1 有效地阻斷了睾丸中精子的產生,從而產生了有效的避孕效果,而沒有與先前研究的男性激素避孕藥相關的負面副作用。

Product Citation+6

  1. Amjad Ali, Jasmin Shafarin, et al. “Co-targeting BET bromodomain BRD4 and RAC1 suppresses growth, stemness and tumorigenesis by disrupting the c-MYC-G9a-FTH1axis and downregulating HDAC1 in molecular subtypes of breast cancer.” Int J Biol Sci. 2021 Oct 25;17(15):4474-4492.PMID:34803511
  2. Victor Cy Mak, Xinran Li, et al. “p85β alters response to EGFR inhibitor in ovarian cancer through p38 MAPK-mediated regulation of DNA repair.” Neoplasia. 2021 Jul;23(7):718-730.PMID:34144267
  3. Lars Pache, Matthew D. Marsden, et al. “Pharmacological Activation of Non-canonical NF-κB Signaling Activates Latent HIV-1 Reservoirs In Vivo.” Cell Rep Med. 2020 Jun 23;1(3):100037.PMID:33205060
  4. Niklas Remke, Savita Bisht, et al. “Selective BET-bromodomain inhibition by JQ1 suppresses dendritic cell maturation and antigen-specific T-cell responses.” Cancer Immunol Immunother. 2020 Jul 10.PMID:32651619
  5. Xiang Y, Tanaka Y, et al. “Dysregulation of BRD4 Function Underlies the Functional Abnormalities of MeCP2 Mutant Neurons.” Mol Cell. 2020;79(1):84-98.e9.PMID:32526163
  6. Wu SY, Lee CF, et al. “Opposing Functions of BRD4 Isoforms in Breast Cancer.” Mol Cell. 2020;78(6):1114-1132.e10.PMID:32446320
品項 CAS# #貨號 應用
Romidepsin (FK228, depsipeptide)

CAS#128517-07-7

 

貨號A8173 HDAC1/HDAC2,強效和選擇性抑制劑
Pirarubicin CAS#72496-41-4 貨號B2295  anthracycline anti-neoplastic doxorubicin
Tunicamycin CAS# 15663-27-1

貨號A8321

 

高效、廣譜的化療藥物
Azithromycin CAS#83905-01-5  貨號A2213 Hsp90 inhibitor
Bleomycin Sulfate

CAS# 9041-93-4

 

貨號B1398 Antibiotic by inhibiting protein synthesis
Nystatin (Fungicidin) CAS#1400-61-9 貨號B1993 antifungal antibiotic
Rapamycin CAS#53123-88-9 貨號A8167 Original antifungal antibiotic
Daptomycin CAS#103060-53-3 貨號A1206 Calcium-dependent antibiotic

 

品項 CAS# #貨號 應用
MG 149  (Tip60 HAT inhibitor) 選擇性抑制劑  CAS# 1243583-85-8 貨號 B3276 HAT inhibitor
4′-bromo-Resveratrol CAS# 1224713-90-9  貨號 C3552 Sirt1 和 Sirt3 抑制劑
MS023 CAS# 1831110-54-3 貨號 B6183 type I PRMTs inhibitor抑制劑
CHZ868 N/O 貨號B5980 Type II JAK2 inhibitor
Chidamide CAS#743420-02-2 貨號B5916 Novel HDAC inhibitor
RGFP966 CAS#1357389-11-7/1396841-57-8 貨號A8803 Specific HDAC3 inhibitor
EPZ-6438 CAS#1403254-99-8 貨號A8221 EZH2 inhibitor, potent and selective
Bromodomain Inhibitor, (+)-JQ1 CAS# 1268524-70-4 貨號A1910 BET bromodomain inhibitor

 

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